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公布：平成１７年４月２７日政令第１６９号 施行：平成１７年６月１日 改正：平成１７年１２月１４日政令第３６２号 施行：平成１８年２月１日（附則第１条ただし書：平成１７年１２月１４日） 改正：平成１８年７月２１日政令第２４０号 施行：平成１８年９月１日附則第１条ただし書：平成１８年７月２１日） |
| 科名 | 種名 |
| 第一 動物界 一 哺乳綱 （一） カンガルー目 | |
| クスクス科 | トリコスルス・ヴルペクラ（フクロギツネ） |
| （二） 食虫目 | |
| はりねずみ科 | エリナケウス属（ハリネズミ属）全種 |
| （三） 霊長目 | |
| おながざる科 | マカカ・キュクロピス（タイワンザル） マカカ・ファスキクラリス（カニクイザル） マカカ・ムラタ（アカゲザル） |
| （四） 齧歯目 | |
| ヌートリア科 | ミュオカストル・コィプス（ヌートリア） |
| りす科 | カルロスキウルス・エリュトラエウス（クリハラリス） プテロミュス・ヴォランス（タイリクモモンガ）のうちプテロミュス・ヴォランス・オリイ（エゾモモンガ）以外のもの スキウルス・カロリネンスィス（トウブハイイロリス） スキウルス・ヴルガリス（キタリス）のうちスキウルス・ヴルガリス・オリエンティス（エゾリス）以外のもの |
| ねずみ科 | オンダトラ・ズィベティクス（マスクラット） |
| （五） 食肉目 | |
| あらいぐま科 | プロキュオン・カンクリヴォルス（カニクイアライグマ） プロキュオン・ロトル（アライグマ） |
| いたち科 | ムステラ・ヴィソン（アメリカミンク） |
| マングース科 | ヘルペステス・ヤヴァニクス（ジャワマングース） |
| （六） 偶蹄目 | |
| しか科 | アクスィス属（アキシスジカ属）全種 ケルヴス属（シカ属）に属する種のうちケルヴス・ニポン・ケントラリス（ホンシュウジカ）、ケルヴス・ニポン・ケラマエ（ケラマジカ）、ケルヴス・ニポン・マゲシマエ（マゲシカ）、ケルヴス・ニポン・ニポン（キュウシュウジカ）、ケルヴス・ニポン・プルケルルス（ツシマジカ）、ケルヴス・ニポン・ヤクシマエ（ヤクシカ）及びケルヴス・ニポン・イェソエンスィス（エゾシカ）以外のもの ダマ属（ダマシカ属）全種 エラフルス・ダヴィディアヌス（シフゾウ） ムンティアクス・レエヴェスィ（キョン） |
| 二 鳥綱 すずめ目 | |
| ちめどり科 | ガルルラクス・カノルス（ガビチョウ） ガルルラクス・ペルスピキルラトゥス（カオグロガビチョウ） ガルルラクス・サンニオ（カオジロガビチョウ） レイオトリクス・ルテア（ソウシチョウ） |
| 三 爬虫綱 （一） かめ目 | |
| かみつきがめ科 | ケリュドラ・セルペンティナ（カミツキガメ） |
| （二） とかげ亜目 | |
| たてがみとかげ科 | アノリス・カロリネンスィス（グリーンアノール） アノリス・サグレイ（ブラウンアノール） |
| （三） へび亜目 | |
| なみへび科 | ボイガ・イルレグラリス（ミナミオオガシラ） エラフェ・タエニウラ・フリエスィ（タイワンスジオ） |
| くさりへび科 | プロトボトロプス・ムクロスカマトゥス（タイワンハブ） |
| 四 両生綱 無尾目 | |
| ひきがえる科 | ブフォ・マリヌス（オオヒキガエル） |
| あまがえる科 | オステオピルス・セプテントリオナリス（キューバズツキガエル） |
| ゆびなががえる科 | エレウテロダクテュルス・コクイ（コキーコヤスガエル） |
| あかがえる科 | ラナ・カテスベイアナ（ウシガエル） |
| あおがえる科 | ポリュペダテス・レウコミュスタクス（シロアゴガエル） |
| 五 条鰭亜綱 （一） なまず目 | |
| イクタルルス科 | イクタルルス・プンクタトゥス（チャネルキャットフィッシュ） |
| （二） かわかます目 | |
| かわかます科 | エソクス・ルキウス（ノーザンパイク） |
| エソクス・マスクイノンギュ（マスキーパイク） | |
| （三） かだやし目 | |
| かだやし科 | ガンブスィア・アフィニス（カダヤシ） |
| （四） すずき目 | |
| サンフィッシュ科 | レポミス・マクロキルス（ブルーギル） ミクロプテルス・ドロミエウ（コクチバス） ミクロプテルス・サルモイデス（オオクチバス） |
| モロネ科 | モロネ・クリュソプス（ホワイトバス） モロネ・サクサティリス（ストライプトバス） |
| パーチ科 | ぺルカ・フルヴィアティリス（ヨーロピアンパーチ） サンデル・ルキオペルカ（パイクパーチ） |
| けつぎょ科 | スィニペルカ・クアトスィ（ケツギョ） スィニペルカ・スケルゼリ（コウライケツギョ） |
| 六 くも綱 （一） さそり目 | |
| きょくとうさそり科 | きょくとうさそり科全種 |
| （二） くも目 | |
| じょうごぐも科 | アトラクス属全種 ハドロニュケ属全種 |
| いとぐも科 | ロクソスケレス・ガウコ ロクソスケレス・ラエタ ロクソスケレス・レクルサ |
| ひめぐも科 | ラトロデクトゥス・ゲオメトリクス（ハイイロゴケグモ） ラトロデクトゥス・ハセルティイ（セアカゴケグモ） ラトロデクトゥス・マクタンス（クロゴケグモ） ラトロデクトゥス・トレデキムグタトゥス（ジュウサンボシゴケグモ） |
| 七 甲殻綱 えび目 | |
| ざりがに科 | アスタクス属全種 パキファスタクス・レニウスクルス（ウチダザリガニ） |
| アメリカざりがに科 | オルコネクテス・ルスティクス（ラスティークレイフィッシュ） |
| みなみざりがに科 | ケラクス属全種 |
| もくずがに科 | エリオケイル属（モクズガニ属）に属する種のうちエリオケイル・ヤポニカ（モクズガニ）以外のもの |
| 八 昆虫綱 （一） 甲虫目 | |
| こがねむし科 | ケイロトヌス属（テナガコガネ属）に属する種のうちケイロトヌス・ヤンバル（ヤンバルテナガコガネ）以外のもの エウキルス属（クモテナガコガネ属）全種 プロポマクルス属（ヒメテナガコガネ属）全種 |
| （二） はち目 | |
| みつばち科 | ボンブス・テルレストリス（セイヨウオオマルハナバチ） |
| あり科 | リネピテマ・フミレ（アルゼンチンアリ） ソレノプスィス・ゲミナタ（アカカミアリ） ソレノプスィス・インヴィクタ（ヒアリ） ワスマンニア・アウロプンクタタ（コカミアリ） |
| 九 二枚貝綱 （一） いがい目 | |
| いがい科 | リムノペルナ属（カワヒバリガイ属）全種 |
| （二） まるすだれがい目 | |
| かわほととぎすがい科 | ドレイセナ・ブゲンスィス（クワッガガイ） ドレイセナ・ポリュモルファ（カワホトトギスガイ） |
| 一〇 腹足綱 まいまい目 | |
| スピラクスィダエ科 | エウグランディナ・ロセア（ヤマヒタチオビ） |
| 一一 渦虫綱 三岐腸目 | |
| やりがたりくうずむし科 | プラテュデムス・マノクワリ（ニューギニアヤリガタリクウズムシ） |
| 第二 植物界 | |
| ひゆ科 | アルテルナンテラ・フィロクセロイデス（ナガエツルノゲイトウ） |
| せり科 | ヒュドロコティレ・ラヌンクロイデス（ブラジルチドメグサ） |
| さといも科 | ピスティア・ストラティオテス（ボタンウキクサ） |
| あかうきくさ科 | アゾルラ・クリスタタ |
| きく科 | コレオプスィス・ランケオラタ（オオキンケイギク） ギュムノコロニス・スピラントイデス（ミズヒマワリ） ルドベキア・ラキニアタ（オオハンゴンソウ） セネキオ・マダガスカリエンスィス（ナルトサワギク） |
| うり科 | スィキュオス・アングラトゥス（アレチウリ） |
| ありのとうぐさ科 | ミュリオフュルルム・アクアティクム（オオフサモ） |
| いね科 | スパルティナ・アングリカ |
| ごまのはぐさ科 | ヴェロニカ・アナガルリス−アクアティカ（オオカワヂシャ） |
| 備考 括弧内に記載する呼称は、和名である。 | |
| 種名 | 器官 |
| アルテルナンテラ・フィロクセロイデス（ナガエツルノゲイトウ） | 茎、根 |
| ヒュドロコティレ・ラヌンクロイデス（ブラジルチドメグサ） | 茎、根 |
| ピスティア・ストラティオテス（ボタンウキクサ） | 茎、根 |
| アゾルラ・クリスタタ | 茎 |
| コレオプスィス・ランケオラタ（オオキンケイギク） | 根 |
| ギュムノコロニス・スピラントイデス（ミズヒマワリ） | 茎、根 |
| ルドベキア・ラキニアタ（オオハンゴンソウ） | 根 |
| セネキオ・マダガスカリエンスィス（ナルトサワギク） | 茎、根 |
| ミュリオフュルルム・アクアティクム（オオフサモ） | 茎、根 |
| スパルティナ・アングリカ | 茎、根 |
| ヴェロニカ・アナガルリス−アクアティカ（オオカワヂシャ） | 根 |
| 備考 括弧内に記載する呼称は、和名である。 | |
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